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销售折扣单独开发票是不能扣除的。

请看这是国税总局的规定：
《国家税务总局关于折扣额抵减增值税应税销售额问题的通知》
国税函〔2010〕56号

各省、自治区、直辖市和计划单列市国家税务局：
近有部分地区反映，纳税人采取折扣方式销售货物，虽在同一发 票上注明了销售额和折扣额，却将折扣额填写在发 票的备注栏，是否允许抵减销售额的问题。经研究，现将有关问题进一步明确如下：
《国家税务总局关于印发〈增值税若干具体问题的规定〉的通知》（国税发[1993]154号）第二条第（二）项规定：“纳税人采取折扣方式销售货物，如果销售额和折扣额在同一张发 票上分别注明的，可按折扣后的销售额征收增值税”。纳税人采取折扣方式销售货物，销售额和折扣额在同一张发票上分别注明是指销售额和折扣额在同一张发 票上的“金额”栏分别注明的，可按折扣后的销售额征收增值税。未在同一张发 票“金额”栏注明折扣额，而仅在发 票的“备注”栏注明折扣额的，折扣额不得从销售额中减除。
国家税务总局
二○一○年二月八日