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在建筑公司进行苗木采购项目时，开具发票的过程需要遵循一定的步骤。首先，建筑公司作为购买方，必须提供自身的开票信息，包括公司名称、地址和联系电话等。其次，苗木供应商作为销售方，也需要提供详细的开票信息，同样包括公司名称、地址和联系电话。接着，双方需要确定发票的具体内容，比如苗木的种类、数量以及价格等信息。

在确认了所有必要信息后，苗木供应商将依据税务规定填写发票内容。发票上必须包含购买方和销售方的详细信息、发票号码、开票日期、项目名称、规格型号、数量、单价、金额、税率和税额等信息，并且需要加盖销售方的发票专用章。建筑公司在收到发票后，需要对其进行仔细核对，确保发票内容与实际采购情况完全一致，从而保证发票的准确性。

最后，建筑公司按照自身的财务流程办理报销手续。这包括将发票存档、归档，并填写相应的报销单。需要注意的是，具体的开票流程可能会因为不同地区的税务政策和公司内部规定而有所差异，因此在实际操作过程中，务必遵循相关规定。

值得注意的是，开具发票时还需要关注发票的合规性，确保所有信息准确无误，符合国家税务法规的要求。此外，发票的存档和归档工作也非常重要，这有助于公司日后进行财务审计和税务检查。

总之，建筑公司在进行苗木采购项目时，开具发票的过程需要严格遵循相关规定和流程，确保每一个环节都符合要求，从而避免潜在的税务风险。

红字发票目前只能是全额一次性开具，所以只能开具最初发票的金额，不能减去折扣金额。

其实，如果一定要按折扣后的金额开红字发票，则还需要进一步对原折扣发票再做反冲处理。